Здравствуйте! Скорее всего проблема в условных участках. Условными участками на карту наносятся земельные участки для которых нет координатного описания в КПТ. Эти объекты расположены в левом нижнем углу карты и представляют из себя площадные участки 10х10 метров.
Остальные объекты наносятся на карту с координатами из КПТ.
Если проблема не в условных участках, то укажите кадастровые номера объектов, которые "улетают".